Protein–RNA interactions for Protein: P07607

Tyms, Thymidylate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TymsP07607 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TymsP07607 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TymsP07607 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TymsP07607 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TymsP07607 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TymsP07607 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TymsP07607 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TymsP07607 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TymsP07607 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TymsP07607 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TymsP07607 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TymsP07607 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TymsP07607 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TymsP07607 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TymsP07607 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TymsP07607 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TymsP07607 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TymsP07607 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TymsP07607 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TymsP07607 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TymsP07607 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TymsP07607 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TymsP07607 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TymsP07607 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TymsP07607 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TymsP07607 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TymsP07607 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TymsP07607 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TymsP07607 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TymsP07607 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TymsP07607 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TymsP07607 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TymsP07607 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TymsP07607 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TymsP07607 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TymsP07607 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TymsP07607 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TymsP07607 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TymsP07607 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TymsP07607 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TymsP07607 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TymsP07607 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TymsP07607 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TymsP07607 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TymsP07607 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TymsP07607 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TymsP07607 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TymsP07607 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TymsP07607 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TymsP07607 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TymsP07607 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TymsP07607 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TymsP07607 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TymsP07607 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TymsP07607 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TymsP07607 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TymsP07607 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TymsP07607 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TymsP07607 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TymsP07607 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TymsP07607 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TymsP07607 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TymsP07607 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TymsP07607 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TymsP07607 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TymsP07607 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TymsP07607 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TymsP07607 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TymsP07607 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TymsP07607 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TymsP07607 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TymsP07607 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TymsP07607 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TymsP07607 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TymsP07607 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TymsP07607 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TymsP07607 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TymsP07607 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TymsP07607 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TymsP07607 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TymsP07607 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TymsP07607 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TymsP07607 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TymsP07607 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TymsP07607 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TymsP07607 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TymsP07607 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TymsP07607 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TymsP07607 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TymsP07607 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TymsP07607 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TymsP07607 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TymsP07607 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TymsP07607 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TymsP07607 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TymsP07607 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TymsP07607 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TymsP07607 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TymsP07607 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TymsP07607 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms