Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgamP05555 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgamP05555 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgamP05555 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgamP05555 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ItgamP05555 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ItgamP05555 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgamP05555 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgamP05555 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgamP05555 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgamP05555 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms