Protein–RNA interactions for Protein: P01887

B2m, Beta-2-microglobulin, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B2mP01887 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B2mP01887 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B2mP01887 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B2mP01887 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B2mP01887 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B2mP01887 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B2mP01887 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
B2mP01887 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
B2mP01887 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
B2mP01887 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
B2mP01887 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B2mP01887 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B2mP01887 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B2mP01887 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B2mP01887 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B2mP01887 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
B2mP01887 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B2mP01887 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B2mP01887 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B2mP01887 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B2mP01887 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B2mP01887 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B2mP01887 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B2mP01887 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B2mP01887 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B2mP01887 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B2mP01887 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B2mP01887 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B2mP01887 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B2mP01887 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B2mP01887 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B2mP01887 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B2mP01887 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B2mP01887 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B2mP01887 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B2mP01887 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B2mP01887 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B2mP01887 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B2mP01887 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B2mP01887 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B2mP01887 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B2mP01887 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B2mP01887 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B2mP01887 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B2mP01887 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B2mP01887 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B2mP01887 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B2mP01887 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B2mP01887 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B2mP01887 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B2mP01887 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B2mP01887 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B2mP01887 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B2mP01887 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B2mP01887 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
B2mP01887 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B2mP01887 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B2mP01887 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B2mP01887 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B2mP01887 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B2mP01887 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B2mP01887 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B2mP01887 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B2mP01887 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B2mP01887 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B2mP01887 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B2mP01887 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B2mP01887 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B2mP01887 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B2mP01887 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B2mP01887 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B2mP01887 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B2mP01887 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
B2mP01887 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
B2mP01887 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B2mP01887 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
B2mP01887 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
B2mP01887 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B2mP01887 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
B2mP01887 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B2mP01887 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
B2mP01887 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B2mP01887 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B2mP01887 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
B2mP01887 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B2mP01887 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B2mP01887 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B2mP01887 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B2mP01887 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
B2mP01887 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B2mP01887 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B2mP01887 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
B2mP01887 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B2mP01887 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B2mP01887 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B2mP01887 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
B2mP01887 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B2mP01887 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
B2mP01887 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
B2mP01887 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.4 ms