Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01735 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01735 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01735 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01735 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01735 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01735 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01735 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01735 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01735 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01735 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01735 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01735 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01735 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01735 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01735 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01735 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
P01735 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01735 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01735 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01735 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01735 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01735 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01735 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01735 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01735 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01735 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
P01735 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
P01735 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01735 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01735 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01735 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01735 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01735 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01735 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01735 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01735 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01735 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01735 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01735 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01735 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01735 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01735 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01735 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01735 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01735 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
P01735 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
P01735 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01735 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01735 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01735 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01735 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01735 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01735 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01735 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01735 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01735 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01735 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01735 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01735 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01735 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01735 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01735 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01735 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01735 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01735 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01735 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01735 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01735 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01735 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01735 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01735 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01735 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01735 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01735 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01735 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01735 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01735 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01735 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01735 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01735 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01735 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01735 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01735 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01735 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01735 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01735 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01735 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01735 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01735 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01735 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01735 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01735 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01735 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01735 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01735 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01735 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01735 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01735 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01735 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms