Protein–RNA interactions for Protein: O88990

Actn3, Alpha-actinin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn3O88990 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Actn3O88990 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Actn3O88990 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actn3O88990 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Actn3O88990 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actn3O88990 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actn3O88990 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn3O88990 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn3O88990 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actn3O88990 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Actn3O88990 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actn3O88990 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actn3O88990 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actn3O88990 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actn3O88990 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actn3O88990 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actn3O88990 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actn3O88990 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actn3O88990 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actn3O88990 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actn3O88990 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actn3O88990 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms