Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Tom1O88746 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tom1O88746 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tom1O88746 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tom1O88746 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tom1O88746 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Tom1O88746 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tom1O88746 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tom1O88746 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tom1O88746 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tom1O88746 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tom1O88746 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tom1O88746 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tom1O88746 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Tom1O88746 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tom1O88746 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tom1O88746 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tom1O88746 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tom1O88746 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tom1O88746 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tom1O88746 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tom1O88746 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Tom1O88746 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tom1O88746 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tom1O88746 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tom1O88746 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tom1O88746 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tom1O88746 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tom1O88746 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tom1O88746 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tom1O88746 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tom1O88746 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tom1O88746 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tom1O88746 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tom1O88746 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tom1O88746 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tom1O88746 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tom1O88746 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tom1O88746 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tom1O88746 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tom1O88746 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tom1O88746 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Tom1O88746 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tom1O88746 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tom1O88746 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tom1O88746 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tom1O88746 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tom1O88746 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tom1O88746 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tom1O88746 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tom1O88746 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tom1O88746 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tom1O88746 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tom1O88746 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tom1O88746 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tom1O88746 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tom1O88746 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tom1O88746 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tom1O88746 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tom1O88746 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tom1O88746 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tom1O88746 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tom1O88746 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tom1O88746 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tom1O88746 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tom1O88746 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tom1O88746 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tom1O88746 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tom1O88746 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tom1O88746 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tom1O88746 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tom1O88746 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tom1O88746 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tom1O88746 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tom1O88746 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tom1O88746 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tom1O88746 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tom1O88746 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Tom1O88746 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Tom1O88746 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tom1O88746 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tom1O88746 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Tom1O88746 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tom1O88746 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tom1O88746 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tom1O88746 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tom1O88746 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tom1O88746 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tom1O88746 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tom1O88746 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tom1O88746 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tom1O88746 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tom1O88746 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Tom1O88746 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tom1O88746 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tom1O88746 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Tom1O88746 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tom1O88746 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tom1O88746 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tom1O88746 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms