Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ChkbO55229 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ChkbO55229 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ChkbO55229 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ChkbO55229 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChkbO55229 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms