Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp2a2O55143 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp2a2O55143 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms