Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smarce1O54941 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarce1O54941 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarce1O54941 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms