Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TsksO54887 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TsksO54887 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TsksO54887 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TsksO54887 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TsksO54887 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TsksO54887 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TsksO54887 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TsksO54887 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TsksO54887 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TsksO54887 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TsksO54887 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TsksO54887 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TsksO54887 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TsksO54887 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TsksO54887 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TsksO54887 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TsksO54887 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TsksO54887 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TsksO54887 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TsksO54887 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TsksO54887 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TsksO54887 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TsksO54887 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TsksO54887 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TsksO54887 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TsksO54887 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TsksO54887 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TsksO54887 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TsksO54887 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TsksO54887 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TsksO54887 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TsksO54887 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TsksO54887 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TsksO54887 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TsksO54887 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TsksO54887 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TsksO54887 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TsksO54887 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TsksO54887 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TsksO54887 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TsksO54887 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TsksO54887 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TsksO54887 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TsksO54887 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TsksO54887 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TsksO54887 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TsksO54887 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TsksO54887 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TsksO54887 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TsksO54887 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TsksO54887 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TsksO54887 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TsksO54887 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TsksO54887 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TsksO54887 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TsksO54887 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TsksO54887 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TsksO54887 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TsksO54887 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TsksO54887 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TsksO54887 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TsksO54887 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TsksO54887 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TsksO54887 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TsksO54887 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TsksO54887 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TsksO54887 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TsksO54887 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TsksO54887 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TsksO54887 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TsksO54887 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TsksO54887 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TsksO54887 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TsksO54887 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TsksO54887 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TsksO54887 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TsksO54887 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TsksO54887 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TsksO54887 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TsksO54887 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TsksO54887 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TsksO54887 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TsksO54887 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TsksO54887 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TsksO54887 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TsksO54887 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TsksO54887 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TsksO54887 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TsksO54887 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TsksO54887 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TsksO54887 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TsksO54887 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TsksO54887 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TsksO54887 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TsksO54887 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TsksO54887 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TsksO54887 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TsksO54887 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TsksO54887 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms