Protein–RNA interactions for Protein: O54709

Klrk1, NKG2-D type II integral membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klrk1O54709 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Klrk1O54709 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Klrk1O54709 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klrk1O54709 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klrk1O54709 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Klrk1O54709 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Klrk1O54709 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Klrk1O54709 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klrk1O54709 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Klrk1O54709 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Klrk1O54709 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klrk1O54709 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Klrk1O54709 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Klrk1O54709 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klrk1O54709 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klrk1O54709 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klrk1O54709 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Klrk1O54709 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Klrk1O54709 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Klrk1O54709 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klrk1O54709 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klrk1O54709 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klrk1O54709 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klrk1O54709 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Klrk1O54709 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klrk1O54709 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klrk1O54709 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klrk1O54709 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klrk1O54709 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klrk1O54709 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klrk1O54709 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klrk1O54709 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Klrk1O54709 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Klrk1O54709 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms