Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NudcO35685 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NudcO35685 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NudcO35685 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NudcO35685 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NudcO35685 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NudcO35685 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NudcO35685 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NudcO35685 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NudcO35685 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NudcO35685 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NudcO35685 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NudcO35685 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NudcO35685 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NudcO35685 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NudcO35685 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NudcO35685 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NudcO35685 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NudcO35685 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NudcO35685 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NudcO35685 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NudcO35685 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NudcO35685 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NudcO35685 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NudcO35685 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NudcO35685 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NudcO35685 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NudcO35685 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NudcO35685 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NudcO35685 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NudcO35685 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NudcO35685 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NudcO35685 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NudcO35685 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NudcO35685 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NudcO35685 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NudcO35685 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NudcO35685 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NudcO35685 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NudcO35685 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NudcO35685 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NudcO35685 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NudcO35685 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NudcO35685 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NudcO35685 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NudcO35685 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NudcO35685 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NudcO35685 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NudcO35685 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NudcO35685 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NudcO35685 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NudcO35685 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NudcO35685 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NudcO35685 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NudcO35685 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NudcO35685 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NudcO35685 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NudcO35685 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NudcO35685 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NudcO35685 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NudcO35685 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NudcO35685 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NudcO35685 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NudcO35685 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NudcO35685 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NudcO35685 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NudcO35685 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NudcO35685 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NudcO35685 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NudcO35685 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NudcO35685 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NudcO35685 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NudcO35685 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NudcO35685 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NudcO35685 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NudcO35685 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NudcO35685 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NudcO35685 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NudcO35685 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NudcO35685 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NudcO35685 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NudcO35685 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NudcO35685 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NudcO35685 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NudcO35685 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NudcO35685 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NudcO35685 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NudcO35685 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NudcO35685 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NudcO35685 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NudcO35685 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NudcO35685 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NudcO35685 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NudcO35685 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NudcO35685 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NudcO35685 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NudcO35685 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NudcO35685 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NudcO35685 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NudcO35685 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms