Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Edil3O35474 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Edil3O35474 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Edil3O35474 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Edil3O35474 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Edil3O35474 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Edil3O35474 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Edil3O35474 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Edil3O35474 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Edil3O35474 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Edil3O35474 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Edil3O35474 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Edil3O35474 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Edil3O35474 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Edil3O35474 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Edil3O35474 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Edil3O35474 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Edil3O35474 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Edil3O35474 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Edil3O35474 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Edil3O35474 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Edil3O35474 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Edil3O35474 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Edil3O35474 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Edil3O35474 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Edil3O35474 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Edil3O35474 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Edil3O35474 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Edil3O35474 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Edil3O35474 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Edil3O35474 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Edil3O35474 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Edil3O35474 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Edil3O35474 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Edil3O35474 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Edil3O35474 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Edil3O35474 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Edil3O35474 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Edil3O35474 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Edil3O35474 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Edil3O35474 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Edil3O35474 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Edil3O35474 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Edil3O35474 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Edil3O35474 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Edil3O35474 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Edil3O35474 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Edil3O35474 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Edil3O35474 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Edil3O35474 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Edil3O35474 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Edil3O35474 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms