Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TnxbO35452 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TnxbO35452 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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TnxbO35452 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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TnxbO35452 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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TnxbO35452 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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TnxbO35452 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TnxbO35452 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TnxbO35452 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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TnxbO35452 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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TnxbO35452 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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TnxbO35452 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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TnxbO35452 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TnxbO35452 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TnxbO35452 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TnxbO35452 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TnxbO35452 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TnxbO35452 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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TnxbO35452 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TnxbO35452 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TnxbO35452 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TnxbO35452 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TnxbO35452 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TnxbO35452 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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TnxbO35452 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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TnxbO35452 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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TnxbO35452 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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TnxbO35452 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TnxbO35452 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TnxbO35452 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TnxbO35452 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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TnxbO35452 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TnxbO35452 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TnxbO35452 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TnxbO35452 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TnxbO35452 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TnxbO35452 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TnxbO35452 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TnxbO35452 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TnxbO35452 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TnxbO35452 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TnxbO35452 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TnxbO35452 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TnxbO35452 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TnxbO35452 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TnxbO35452 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TnxbO35452 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TnxbO35452 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TnxbO35452 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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