Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Barx2O08686 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Barx2O08686 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Barx2O08686 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Barx2O08686 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Barx2O08686 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Barx2O08686 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Barx2O08686 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Barx2O08686 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Barx2O08686 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Barx2O08686 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Barx2O08686 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Barx2O08686 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Barx2O08686 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms