Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Ccdc180J3QNE4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Ccdc180J3QNE4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Ccdc180J3QNE4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
Ccdc180J3QNE4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Ccdc180J3QNE4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ccdc180J3QNE4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ccdc180J3QNE4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ccdc180J3QNE4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Ccdc180J3QNE4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Ccdc180J3QNE4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Ccdc180J3QNE4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Ccdc180J3QNE4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Ccdc180J3QNE4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Ccdc180J3QNE4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Ccdc180J3QNE4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Ccdc180J3QNE4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Ccdc180J3QNE4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Ccdc180J3QNE4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Ccdc180J3QNE4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Ccdc180J3QNE4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Ccdc180J3QNE4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Ccdc180J3QNE4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Ccdc180J3QNE4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
Ccdc180J3QNE4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Ccdc180J3QNE4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Ccdc180J3QNE4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Ccdc180J3QNE4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Ccdc180J3QNE4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Ccdc180J3QNE4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Ccdc180J3QNE4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Ccdc180J3QNE4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Ccdc180J3QNE4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Ccdc180J3QNE4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Ccdc180J3QNE4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Ccdc180J3QNE4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Ccdc180J3QNE4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Ccdc180J3QNE4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Ccdc180J3QNE4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Ccdc180J3QNE4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Ccdc180J3QNE4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Ccdc180J3QNE4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Ccdc180J3QNE4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Ccdc180J3QNE4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Ccdc180J3QNE4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Ccdc180J3QNE4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Ccdc180J3QNE4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Ccdc180J3QNE4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Ccdc180J3QNE4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Ccdc180J3QNE4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Ccdc180J3QNE4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Ccdc180J3QNE4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Ccdc180J3QNE4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Ccdc180J3QNE4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Ccdc180J3QNE4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Ccdc180J3QNE4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Ccdc180J3QNE4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Ccdc180J3QNE4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Ccdc180J3QNE4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ccdc180J3QNE4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Ccdc180J3QNE4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ccdc180J3QNE4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ccdc180J3QNE4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Ccdc180J3QNE4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Ccdc180J3QNE4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Ccdc180J3QNE4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Ccdc180J3QNE4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC36.76■■■■□ 3.47
Ccdc180J3QNE4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Ccdc180J3QNE4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Ccdc180J3QNE4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Ccdc180J3QNE4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ccdc180J3QNE4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ccdc180J3QNE4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ccdc180J3QNE4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ccdc180J3QNE4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ccdc180J3QNE4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
Ccdc180J3QNE4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ccdc180J3QNE4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ccdc180J3QNE4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
Ccdc180J3QNE4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
Ccdc180J3QNE4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Ccdc180J3QNE4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Ccdc180J3QNE4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Ccdc180J3QNE4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ccdc180J3QNE4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ccdc180J3QNE4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ccdc180J3QNE4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ccdc180J3QNE4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ccdc180J3QNE4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
Ccdc180J3QNE4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Ccdc180J3QNE4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Ccdc180J3QNE4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Ccdc180J3QNE4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Ccdc180J3QNE4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ccdc180J3QNE4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ccdc180J3QNE4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Ccdc180J3QNE4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Ccdc180J3QNE4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Ccdc180J3QNE4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Ccdc180J3QNE4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms