Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nkx1-1G3UXB3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nkx1-1G3UXB3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nkx1-1G3UXB3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx1-1G3UXB3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx1-1G3UXB3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx1-1G3UXB3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx1-1G3UXB3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkx1-1G3UXB3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkx1-1G3UXB3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkx1-1G3UXB3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkx1-1G3UXB3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkx1-1G3UXB3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx1-1G3UXB3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx1-1G3UXB3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx1-1G3UXB3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx1-1G3UXB3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx1-1G3UXB3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkx1-1G3UXB3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkx1-1G3UXB3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkx1-1G3UXB3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkx1-1G3UXB3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkx1-1G3UXB3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkx1-1G3UXB3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkx1-1G3UXB3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkx1-1G3UXB3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkx1-1G3UXB3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkx1-1G3UXB3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx1-1G3UXB3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx1-1G3UXB3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx1-1G3UXB3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx1-1G3UXB3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx1-1G3UXB3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx1-1G3UXB3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx1-1G3UXB3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx1-1G3UXB3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx1-1G3UXB3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx1-1G3UXB3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx1-1G3UXB3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx1-1G3UXB3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx1-1G3UXB3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx1-1G3UXB3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx1-1G3UXB3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx1-1G3UXB3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx1-1G3UXB3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx1-1G3UXB3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx1-1G3UXB3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx1-1G3UXB3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx1-1G3UXB3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx1-1G3UXB3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx1-1G3UXB3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx1-1G3UXB3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx1-1G3UXB3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx1-1G3UXB3 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx1-1G3UXB3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx1-1G3UXB3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx1-1G3UXB3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkx1-1G3UXB3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkx1-1G3UXB3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkx1-1G3UXB3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkx1-1G3UXB3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkx1-1G3UXB3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkx1-1G3UXB3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx1-1G3UXB3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx1-1G3UXB3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx1-1G3UXB3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx1-1G3UXB3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx1-1G3UXB3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx1-1G3UXB3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms