Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Crocc2F6XLV1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Crocc2F6XLV1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Crocc2F6XLV1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Crocc2F6XLV1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Crocc2F6XLV1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Crocc2F6XLV1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Crocc2F6XLV1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Crocc2F6XLV1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Crocc2F6XLV1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Crocc2F6XLV1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Crocc2F6XLV1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Crocc2F6XLV1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Crocc2F6XLV1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Crocc2F6XLV1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Crocc2F6XLV1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Crocc2F6XLV1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Crocc2F6XLV1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Crocc2F6XLV1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Crocc2F6XLV1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Crocc2F6XLV1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Crocc2F6XLV1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Crocc2F6XLV1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Crocc2F6XLV1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Crocc2F6XLV1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Crocc2F6XLV1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Crocc2F6XLV1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Crocc2F6XLV1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Crocc2F6XLV1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Crocc2F6XLV1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Crocc2F6XLV1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Crocc2F6XLV1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Crocc2F6XLV1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Crocc2F6XLV1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Crocc2F6XLV1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Crocc2F6XLV1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Crocc2F6XLV1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Crocc2F6XLV1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Crocc2F6XLV1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Crocc2F6XLV1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Crocc2F6XLV1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Crocc2F6XLV1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Crocc2F6XLV1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Crocc2F6XLV1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Crocc2F6XLV1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Crocc2F6XLV1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Crocc2F6XLV1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Crocc2F6XLV1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Crocc2F6XLV1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Crocc2F6XLV1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Crocc2F6XLV1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Crocc2F6XLV1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Crocc2F6XLV1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Crocc2F6XLV1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Crocc2F6XLV1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Crocc2F6XLV1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Crocc2F6XLV1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Crocc2F6XLV1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Crocc2F6XLV1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Crocc2F6XLV1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Crocc2F6XLV1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Crocc2F6XLV1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Crocc2F6XLV1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Crocc2F6XLV1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Crocc2F6XLV1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Crocc2F6XLV1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Crocc2F6XLV1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Crocc2F6XLV1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Crocc2F6XLV1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Crocc2F6XLV1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Crocc2F6XLV1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Crocc2F6XLV1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Crocc2F6XLV1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Crocc2F6XLV1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Crocc2F6XLV1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Crocc2F6XLV1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Crocc2F6XLV1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Crocc2F6XLV1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Crocc2F6XLV1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Crocc2F6XLV1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Crocc2F6XLV1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Crocc2F6XLV1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Crocc2F6XLV1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Crocc2F6XLV1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Crocc2F6XLV1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Crocc2F6XLV1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Crocc2F6XLV1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Crocc2F6XLV1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Crocc2F6XLV1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Crocc2F6XLV1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Crocc2F6XLV1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Crocc2F6XLV1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Crocc2F6XLV1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Crocc2F6XLV1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Crocc2F6XLV1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Crocc2F6XLV1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Crocc2F6XLV1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Crocc2F6XLV1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Crocc2F6XLV1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Crocc2F6XLV1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms