Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc85cE9Q6B2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc85cE9Q6B2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc85cE9Q6B2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc85cE9Q6B2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms