Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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FancfE9Q5Z5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
FancfE9Q5Z5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
FancfE9Q5Z5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FancfE9Q5Z5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FancfE9Q5Z5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FancfE9Q5Z5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FancfE9Q5Z5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
FancfE9Q5Z5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FancfE9Q5Z5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FancfE9Q5Z5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FancfE9Q5Z5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FancfE9Q5Z5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FancfE9Q5Z5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FancfE9Q5Z5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FancfE9Q5Z5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FancfE9Q5Z5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FancfE9Q5Z5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FancfE9Q5Z5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FancfE9Q5Z5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FancfE9Q5Z5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FancfE9Q5Z5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FancfE9Q5Z5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FancfE9Q5Z5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FancfE9Q5Z5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FancfE9Q5Z5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FancfE9Q5Z5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms