Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5G2

Pcdhb9, Protocadherin beta 9, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb9E9Q5G2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdhb9E9Q5G2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdhb9E9Q5G2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdhb9E9Q5G2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdhb9E9Q5G2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdhb9E9Q5G2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdhb9E9Q5G2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdhb9E9Q5G2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdhb9E9Q5G2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdhb9E9Q5G2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdhb9E9Q5G2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdhb9E9Q5G2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdhb9E9Q5G2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdhb9E9Q5G2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdhb9E9Q5G2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdhb9E9Q5G2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdhb9E9Q5G2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdhb9E9Q5G2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms