Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Susd1E9Q3H4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms