Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Fndc1E9Q043 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Fndc1E9Q043 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Fndc1E9Q043 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Fndc1E9Q043 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Fndc1E9Q043 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Fndc1E9Q043 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Fndc1E9Q043 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Fndc1E9Q043 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Fndc1E9Q043 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Fndc1E9Q043 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Fndc1E9Q043 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Fndc1E9Q043 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Fndc1E9Q043 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Fndc1E9Q043 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Fndc1E9Q043 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Fndc1E9Q043 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Fndc1E9Q043 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Fndc1E9Q043 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Fndc1E9Q043 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Fndc1E9Q043 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Fndc1E9Q043 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Fndc1E9Q043 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Fndc1E9Q043 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Fndc1E9Q043 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Fndc1E9Q043 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Fndc1E9Q043 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Fndc1E9Q043 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Fndc1E9Q043 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Fndc1E9Q043 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Fndc1E9Q043 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Fndc1E9Q043 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Fndc1E9Q043 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Fndc1E9Q043 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Fndc1E9Q043 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Fndc1E9Q043 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Fndc1E9Q043 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Fndc1E9Q043 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Fndc1E9Q043 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Fndc1E9Q043 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Fndc1E9Q043 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Fndc1E9Q043 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Fndc1E9Q043 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Fndc1E9Q043 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Fndc1E9Q043 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Fndc1E9Q043 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Fndc1E9Q043 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Fndc1E9Q043 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Fndc1E9Q043 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Fndc1E9Q043 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Fndc1E9Q043 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Fndc1E9Q043 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Fndc1E9Q043 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Fndc1E9Q043 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Fndc1E9Q043 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Fndc1E9Q043 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Fndc1E9Q043 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Fndc1E9Q043 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Fndc1E9Q043 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Fndc1E9Q043 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Fndc1E9Q043 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Fndc1E9Q043 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Fndc1E9Q043 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Fndc1E9Q043 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Fndc1E9Q043 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Fndc1E9Q043 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Fndc1E9Q043 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Fndc1E9Q043 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Fndc1E9Q043 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Fndc1E9Q043 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Fndc1E9Q043 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Fndc1E9Q043 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Fndc1E9Q043 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Fndc1E9Q043 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Fndc1E9Q043 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Fndc1E9Q043 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Fndc1E9Q043 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Fndc1E9Q043 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Fndc1E9Q043 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Fndc1E9Q043 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Fndc1E9Q043 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Fndc1E9Q043 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Fndc1E9Q043 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Fndc1E9Q043 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Fndc1E9Q043 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Fndc1E9Q043 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Fndc1E9Q043 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Fndc1E9Q043 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Fndc1E9Q043 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Fndc1E9Q043 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Fndc1E9Q043 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Fndc1E9Q043 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Fndc1E9Q043 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Fndc1E9Q043 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Fndc1E9Q043 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Fndc1E9Q043 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Fndc1E9Q043 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Fndc1E9Q043 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Fndc1E9Q043 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Fndc1E9Q043 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms