Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Scaf11E9PZM7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Scaf11E9PZM7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Scaf11E9PZM7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Scaf11E9PZM7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Scaf11E9PZM7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Scaf11E9PZM7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Scaf11E9PZM7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Scaf11E9PZM7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Scaf11E9PZM7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Scaf11E9PZM7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Scaf11E9PZM7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Scaf11E9PZM7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Scaf11E9PZM7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Scaf11E9PZM7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Scaf11E9PZM7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Scaf11E9PZM7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Scaf11E9PZM7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Scaf11E9PZM7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Scaf11E9PZM7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Scaf11E9PZM7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Scaf11E9PZM7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Scaf11E9PZM7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Scaf11E9PZM7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Scaf11E9PZM7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Scaf11E9PZM7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Scaf11E9PZM7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Scaf11E9PZM7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Scaf11E9PZM7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Scaf11E9PZM7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Scaf11E9PZM7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Scaf11E9PZM7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Scaf11E9PZM7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Scaf11E9PZM7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Scaf11E9PZM7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Scaf11E9PZM7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Scaf11E9PZM7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Scaf11E9PZM7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Scaf11E9PZM7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Scaf11E9PZM7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Scaf11E9PZM7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Scaf11E9PZM7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Scaf11E9PZM7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Scaf11E9PZM7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Scaf11E9PZM7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Scaf11E9PZM7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Scaf11E9PZM7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Scaf11E9PZM7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Scaf11E9PZM7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Scaf11E9PZM7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Scaf11E9PZM7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Scaf11E9PZM7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Scaf11E9PZM7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Scaf11E9PZM7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Scaf11E9PZM7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Scaf11E9PZM7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Scaf11E9PZM7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Scaf11E9PZM7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Scaf11E9PZM7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Scaf11E9PZM7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Scaf11E9PZM7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Scaf11E9PZM7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Scaf11E9PZM7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Scaf11E9PZM7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Scaf11E9PZM7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Scaf11E9PZM7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Scaf11E9PZM7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Scaf11E9PZM7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Scaf11E9PZM7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Scaf11E9PZM7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Scaf11E9PZM7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Scaf11E9PZM7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Scaf11E9PZM7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Scaf11E9PZM7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Scaf11E9PZM7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Scaf11E9PZM7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Scaf11E9PZM7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Scaf11E9PZM7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Scaf11E9PZM7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Scaf11E9PZM7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Scaf11E9PZM7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Scaf11E9PZM7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Scaf11E9PZM7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Scaf11E9PZM7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Scaf11E9PZM7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Scaf11E9PZM7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Scaf11E9PZM7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Scaf11E9PZM7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Scaf11E9PZM7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Scaf11E9PZM7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Scaf11E9PZM7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Scaf11E9PZM7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Scaf11E9PZM7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Scaf11E9PZM7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Scaf11E9PZM7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Scaf11E9PZM7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Scaf11E9PZM7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Scaf11E9PZM7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Scaf11E9PZM7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Scaf11E9PZM7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms