Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ttc17E9PVB5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc17E9PVB5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms