Protein–RNA interactions for Protein: E0CXC6

4930558K02Rik, RIKEN cDNA 4930558K02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930558K02RikE0CXC6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930558K02RikE0CXC6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930558K02RikE0CXC6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930558K02RikE0CXC6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms