Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc6D3YZP9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc6D3YZP9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc6D3YZP9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc6D3YZP9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc6D3YZP9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc6D3YZP9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc6D3YZP9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc6D3YZP9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc6D3YZP9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc6D3YZP9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc6D3YZP9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc6D3YZP9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc6D3YZP9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc6D3YZP9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc6D3YZP9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc6D3YZP9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc6D3YZP9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc6D3YZP9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc6D3YZP9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc6D3YZP9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc6D3YZP9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc6D3YZP9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc6D3YZP9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc6D3YZP9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc6D3YZP9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc6D3YZP9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc6D3YZP9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc6D3YZP9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc6D3YZP9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc6D3YZP9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc6D3YZP9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc6D3YZP9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc6D3YZP9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc6D3YZP9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc6D3YZP9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc6D3YZP9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc6D3YZP9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc6D3YZP9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc6D3YZP9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc6D3YZP9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc6D3YZP9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc6D3YZP9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc6D3YZP9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc6D3YZP9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc6D3YZP9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc6D3YZP9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc6D3YZP9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc6D3YZP9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc6D3YZP9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc6D3YZP9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc6D3YZP9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc6D3YZP9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc6D3YZP9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc6D3YZP9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc6D3YZP9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc6D3YZP9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc6D3YZP9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc6D3YZP9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc6D3YZP9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc6D3YZP9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc6D3YZP9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc6D3YZP9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms