Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SafbD3YXK2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SafbD3YXK2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms