Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tmf1B9EKI3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Tmf1B9EKI3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tmf1B9EKI3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tmf1B9EKI3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tmf1B9EKI3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tmf1B9EKI3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tmf1B9EKI3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tmf1B9EKI3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tmf1B9EKI3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tmf1B9EKI3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tmf1B9EKI3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tmf1B9EKI3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tmf1B9EKI3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tmf1B9EKI3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tmf1B9EKI3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tmf1B9EKI3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tmf1B9EKI3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tmf1B9EKI3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tmf1B9EKI3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tmf1B9EKI3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tmf1B9EKI3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tmf1B9EKI3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tmf1B9EKI3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tmf1B9EKI3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tmf1B9EKI3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Tmf1B9EKI3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tmf1B9EKI3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tmf1B9EKI3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tmf1B9EKI3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tmf1B9EKI3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tmf1B9EKI3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tmf1B9EKI3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tmf1B9EKI3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tmf1B9EKI3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Tmf1B9EKI3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tmf1B9EKI3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tmf1B9EKI3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tmf1B9EKI3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tmf1B9EKI3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tmf1B9EKI3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tmf1B9EKI3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Tmf1B9EKI3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Tmf1B9EKI3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tmf1B9EKI3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms