Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC6

Polr3a, DNA-directed RNA polymerase subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3aB2RXC6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Polr3aB2RXC6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Polr3aB2RXC6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Polr3aB2RXC6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Polr3aB2RXC6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Polr3aB2RXC6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Polr3aB2RXC6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms