Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skint2A7XUX6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms