Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prr16A3KMN5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prr16A3KMN5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prr16A3KMN5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prr16A3KMN5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prr16A3KMN5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prr16A3KMN5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms