Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Patl2A2ARM1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Patl2A2ARM1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Patl2A2ARM1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Patl2A2ARM1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Patl2A2ARM1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Patl2A2ARM1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Patl2A2ARM1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Patl2A2ARM1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Patl2A2ARM1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Patl2A2ARM1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Patl2A2ARM1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Patl2A2ARM1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Patl2A2ARM1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Patl2A2ARM1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Patl2A2ARM1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Patl2A2ARM1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Patl2A2ARM1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Patl2A2ARM1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Patl2A2ARM1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Patl2A2ARM1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Patl2A2ARM1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Patl2A2ARM1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Patl2A2ARM1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Patl2A2ARM1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Patl2A2ARM1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Patl2A2ARM1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Patl2A2ARM1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Patl2A2ARM1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms