Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SetxA2AKX3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms