Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
Frmpd1A2AKB4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Frmpd1A2AKB4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Frmpd1A2AKB4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Frmpd1A2AKB4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Frmpd1A2AKB4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Frmpd1A2AKB4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Frmpd1A2AKB4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Frmpd1A2AKB4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Frmpd1A2AKB4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Frmpd1A2AKB4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Frmpd1A2AKB4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Frmpd1A2AKB4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Frmpd1A2AKB4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
Frmpd1A2AKB4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Frmpd1A2AKB4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Frmpd1A2AKB4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Frmpd1A2AKB4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Frmpd1A2AKB4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Frmpd1A2AKB4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Frmpd1A2AKB4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Frmpd1A2AKB4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Frmpd1A2AKB4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Frmpd1A2AKB4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Frmpd1A2AKB4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Frmpd1A2AKB4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Frmpd1A2AKB4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Frmpd1A2AKB4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Frmpd1A2AKB4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Frmpd1A2AKB4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Frmpd1A2AKB4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Frmpd1A2AKB4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Frmpd1A2AKB4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Frmpd1A2AKB4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Frmpd1A2AKB4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Frmpd1A2AKB4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Frmpd1A2AKB4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Frmpd1A2AKB4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Frmpd1A2AKB4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Frmpd1A2AKB4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Frmpd1A2AKB4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
Frmpd1A2AKB4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Frmpd1A2AKB4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Frmpd1A2AKB4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Frmpd1A2AKB4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Frmpd1A2AKB4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Frmpd1A2AKB4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Frmpd1A2AKB4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Frmpd1A2AKB4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Frmpd1A2AKB4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Frmpd1A2AKB4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Frmpd1A2AKB4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Frmpd1A2AKB4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Frmpd1A2AKB4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Frmpd1A2AKB4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Frmpd1A2AKB4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Frmpd1A2AKB4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Frmpd1A2AKB4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Frmpd1A2AKB4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Frmpd1A2AKB4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Frmpd1A2AKB4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Frmpd1A2AKB4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Frmpd1A2AKB4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Frmpd1A2AKB4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Frmpd1A2AKB4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Frmpd1A2AKB4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Frmpd1A2AKB4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Frmpd1A2AKB4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Frmpd1A2AKB4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Frmpd1A2AKB4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Frmpd1A2AKB4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Frmpd1A2AKB4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Frmpd1A2AKB4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Frmpd1A2AKB4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Frmpd1A2AKB4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Frmpd1A2AKB4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Frmpd1A2AKB4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Frmpd1A2AKB4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Frmpd1A2AKB4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Frmpd1A2AKB4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Frmpd1A2AKB4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Frmpd1A2AKB4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Frmpd1A2AKB4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Frmpd1A2AKB4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Frmpd1A2AKB4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Frmpd1A2AKB4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Frmpd1A2AKB4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Frmpd1A2AKB4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Frmpd1A2AKB4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Frmpd1A2AKB4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Frmpd1A2AKB4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Frmpd1A2AKB4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Frmpd1A2AKB4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Frmpd1A2AKB4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Frmpd1A2AKB4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Frmpd1A2AKB4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Frmpd1A2AKB4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Frmpd1A2AKB4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Frmpd1A2AKB4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Frmpd1A2AKB4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms