Protein–RNA interactions for Protein: A2A5N3

Pabpc1l, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1lA2A5N3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pabpc1lA2A5N3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms