Protein–RNA interactions for Protein: A2A559

Pgap3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgap3A2A559 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pgap3A2A559 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Pgap3A2A559 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pgap3A2A559 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pgap3A2A559 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pgap3A2A559 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pgap3A2A559 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pgap3A2A559 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pgap3A2A559 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pgap3A2A559 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pgap3A2A559 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pgap3A2A559 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pgap3A2A559 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pgap3A2A559 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pgap3A2A559 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pgap3A2A559 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pgap3A2A559 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pgap3A2A559 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pgap3A2A559 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pgap3A2A559 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pgap3A2A559 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms