Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JFS9

Atg4a-ps, Cysteine protease, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg4a-psA0A0G2JFS9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg4a-psA0A0G2JFS9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms