Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WNZ6

1700025B11Rik, RIKEN cDNA 1700025B11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700025B11RikA0A087WNZ6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700025B11RikA0A087WNZ6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700025B11RikA0A087WNZ6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700025B11RikA0A087WNZ6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700025B11RikA0A087WNZ6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700025B11RikA0A087WNZ6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700025B11RikA0A087WNZ6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700025B11RikA0A087WNZ6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700025B11RikA0A087WNZ6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700025B11RikA0A087WNZ6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700025B11RikA0A087WNZ6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700025B11RikA0A087WNZ6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700025B11RikA0A087WNZ6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
1700025B11RikA0A087WNZ6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700025B11RikA0A087WNZ6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700025B11RikA0A087WNZ6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700025B11RikA0A087WNZ6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700025B11RikA0A087WNZ6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700025B11RikA0A087WNZ6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700025B11RikA0A087WNZ6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700025B11RikA0A087WNZ6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700025B11RikA0A087WNZ6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700025B11RikA0A087WNZ6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
1700025B11RikA0A087WNZ6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms