Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm45217-201ENSMUST00000206576 1026 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 AC192616.3-201ENSMUST00000220797 1124 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 3830406C13Rik-205ENSMUST00000223702 900 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Asb11-202ENSMUST00000036858 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Bgn-207ENSMUST00000169489 1574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Olfr55-202ENSMUST00000214888 4675 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Vmn1r-ps110-201ENSMUST00000117530 1094 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm43815-201ENSMUST00000197676 990 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm2691-201ENSMUST00000203205 901 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm44716-201ENSMUST00000209007 710 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm45240-201ENSMUST00000211437 674 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Olfr357-201ENSMUST00000069578 1092 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 C130083A15Rik-201ENSMUST00000205707 1460 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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