Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER71

Rhoj, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhojQ9ER71 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm7583-201ENSMUST00000182941 1005 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm5130-201ENSMUST00000210233 959 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Pcdhgc5-201ENSMUST00000055935 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Tor1aip2-204ENSMUST00000111754 2491 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Zfp42-201ENSMUST00000082120 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Tdp1-201ENSMUST00000021594 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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RhojQ9ER71 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Atxn1-203ENSMUST00000180110 3901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RhojQ9ER71 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RhojQ9ER71 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RhojQ9ER71 Sfmbt2-202ENSMUST00000114861 1813 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RhojQ9ER71 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RhojQ9ER71 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RhojQ9ER71 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RhojQ9ER71 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RhojQ9ER71 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RhojQ9ER71 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RhojQ9ER71 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhojQ9ER71 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhojQ9ER71 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhojQ9ER71 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhojQ9ER71 Zfp948-201ENSMUST00000088787 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhojQ9ER71 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhojQ9ER71 Tnfaip8-212ENSMUST00000179937 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhojQ9ER71 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhojQ9ER71 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhojQ9ER71 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhojQ9ER71 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhojQ9ER71 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhojQ9ER71 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhojQ9ER71 Zfp354a-201ENSMUST00000020628 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhojQ9ER71 Supt20-ps-201ENSMUST00000117999 1560 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RhojQ9ER71 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhojQ9ER71 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhojQ9ER71 Creb3l4-202ENSMUST00000107369 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhojQ9ER71 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RhojQ9ER71 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhojQ9ER71 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhojQ9ER71 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RhojQ9ER71 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RhojQ9ER71 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhojQ9ER71 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
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