Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 AU018091-201ENSMUST00000171749 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Mrpl51-201ENSMUST00000032485 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Gm7696-201ENSMUST00000174727 907 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Pms2-209ENSMUST00000148011 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Idua-201ENSMUST00000071650 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Adgra1-201ENSMUST00000026548 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Fcgr3-204ENSMUST00000169017 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Lrrk2-201ENSMUST00000060642 8275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Kcne1-201ENSMUST00000051705 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Nfia-203ENSMUST00000092532 9382 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Bcl9-207ENSMUST00000166341 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Gm44933-201ENSMUST00000208637 1987 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Pcdhga7-202ENSMUST00000193476 3044 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Nt5c1b-203ENSMUST00000143739 1570 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Wdr37-212ENSMUST00000176922 3780 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Amt-201ENSMUST00000035230 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Blnk-201ENSMUST00000054769 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Slc18a2-201ENSMUST00000026084 3803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Plcd4-201ENSMUST00000027362 2977 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Tnfrsf8-201ENSMUST00000030339 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Gm44570-201ENSMUST00000207526 3698 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Gm42460-201ENSMUST00000198863 2567 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Gm37451-201ENSMUST00000194718 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Gm37350-201ENSMUST00000192782 313 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Gm37976-201ENSMUST00000193827 345 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 AC166165.1-201ENSMUST00000214352 874 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Gcom1-204ENSMUST00000166843 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Tmem252-201ENSMUST00000057243 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Gulo-201ENSMUST00000059970 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Cass4-201ENSMUST00000099061 3731 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Opalin-201ENSMUST00000087176 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Vma21-201ENSMUST00000114575 4290 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cnot2Q8C5L3 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms