Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pnma8aQ80VM8 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Clgn-201ENSMUST00000002259 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Pnma8aQ80VM8 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Pnma8aQ80VM8 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Pnma8aQ80VM8 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
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Pnma8aQ80VM8 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pnma8aQ80VM8 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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