Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Gm11929-201ENSMUST00000118175 945 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Gm14817-201ENSMUST00000148522 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 1700001J04Rik-202ENSMUST00000154037 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Gm17107-201ENSMUST00000170983 553 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Pik3r4-206ENSMUST00000188784 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Gm31466-201ENSMUST00000195457 916 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Gm6008-201ENSMUST00000206542 874 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Gm18596-201ENSMUST00000218133 843 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 AC242269.1-201ENSMUST00000227020 741 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Xlr4b-201ENSMUST00000069077 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Bpifb1-201ENSMUST00000028987 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Gm42974-201ENSMUST00000199556 2654 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Rack1-201ENSMUST00000020640 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Gm7052-201ENSMUST00000167568 1512 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Use1-203ENSMUST00000110054 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Gm23999-201ENSMUST00000158057 104 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Gm26978-201ENSMUST00000182843 304 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 AC163646.3-202ENSMUST00000228685 691 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Nmb-201ENSMUST00000026817 705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Gm26440-201ENSMUST00000082591 129 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Ucp1-201ENSMUST00000034146 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Zfp386-201ENSMUST00000073551 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Rffl-201ENSMUST00000021036 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Ppp6c-205ENSMUST00000204701 1495 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Trak1Q6PD31 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Bgn-207ENSMUST00000169489 1574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Gm11771-201ENSMUST00000118124 732 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Olfr1060-ps1-201ENSMUST00000118335 943 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Gm15472-201ENSMUST00000141652 847 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Gm5766-202ENSMUST00000161633 799 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Gm29487-201ENSMUST00000190146 256 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trak1Q6PD31 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms