Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12288-201ENSMUST00000121054 1282 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 AI847159-202ENSMUST00000138431 952 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23116-201ENSMUST00000158481 67 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm18635-201ENSMUST00000199020 1060 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44748-201ENSMUST00000206040 658 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 4930405G09Rik-201ENSMUST00000207912 1060 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr897-ps1-201ENSMUST00000213589 935 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 AC145736.1-201ENSMUST00000214661 479 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gm40638-201ENSMUST00000216422 682 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 2900024D18Rik-201ENSMUST00000220700 569 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r47-201ENSMUST00000074881 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gtpbp6Q3U6U5 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1487-203ENSMUST00000209005 2061 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Gtpbp6Q3U6U5 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Gtpbp6Q3U6U5 4930449I24Rik-201ENSMUST00000110598 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15522-201ENSMUST00000134467 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Gtpbp6Q3U6U5 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1461-201ENSMUST00000053772 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Gtpbp6Q3U6U5 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1407-ps1-201ENSMUST00000085885 797 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r196-201ENSMUST00000091735 906 ntAPPRIS P2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Apool-201ENSMUST00000026599 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr134-202ENSMUST00000215900 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms