Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 6330549D23Rik-202ENSMUST00000159536 1102 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm5710-201ENSMUST00000183020 995 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 5031425E22Rik-205ENSMUST00000191186 719 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 9330159N22Rik-201ENSMUST00000221530 1031 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Proca1-202ENSMUST00000078099 1254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm15401-201ENSMUST00000081929 1107 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 4932430I15Rik-201ENSMUST00000180431 3306 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Apol7a-204ENSMUST00000176074 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Adamts4-201ENSMUST00000111314 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm36990-201ENSMUST00000191961 1412 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm25723-201ENSMUST00000104530 126 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 AC107851.1-201ENSMUST00000215982 417 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 CT033781.3-201ENSMUST00000221886 504 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Nsg2-202ENSMUST00000093219 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Hdac7-207ENSMUST00000120683 3701 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Adam6a-201ENSMUST00000053086 2558 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm14147-202ENSMUST00000178211 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm13005-201ENSMUST00000119518 585 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm12551-201ENSMUST00000122073 726 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm26356-201ENSMUST00000158217 283 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm9825-201ENSMUST00000178598 843 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm27241-201ENSMUST00000183517 622 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Tac1-205ENSMUST00000185187 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 AC126939.2-201ENSMUST00000225989 307 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Apoc3-201ENSMUST00000034586 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm19557-201ENSMUST00000182109 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Acsm2-201ENSMUST00000084647 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Esd-201ENSMUST00000022573 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 9130230L23Rik-203ENSMUST00000201351 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm22582-201ENSMUST00000102283 94 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Mup1-202ENSMUST00000103012 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Mup16-202ENSMUST00000107483 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Mup17-201ENSMUST00000107484 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Spp2-202ENSMUST00000176708 710 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Spp2-201ENSMUST00000027518 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Mup2-201ENSMUST00000074700 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Mup7-201ENSMUST00000079697 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Mup19-201ENSMUST00000080606 927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Mir187-201ENSMUST00000083598 61 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm15083-201ENSMUST00000138670 1413 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm11100-201ENSMUST00000112652 1951 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Stmn1-202ENSMUST00000105867 802 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Ccdc141-203ENSMUST00000111833 631 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm13864-201ENSMUST00000119745 785 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 3300005D01Rik-204ENSMUST00000181484 1174 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm29471-201ENSMUST00000190527 700 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm38132-201ENSMUST00000193358 707 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm23786-202ENSMUST00000200181 119 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 CT025579.2-201ENSMUST00000225280 816 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Hba-a1-201ENSMUST00000093209 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Rpl7a-ps8-201ENSMUST00000094754 801 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Fgd1-202ENSMUST00000112685 3240 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm36595-201ENSMUST00000218830 2006 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TrioQ0KL02 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms