Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Myc-207ENSMUST00000188482 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Lnpk-201ENSMUST00000064503 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top2aQ01320 Zfp74-204ENSMUST00000108212 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 AC132833.1-202ENSMUST00000228875 1690 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Pla2g5-203ENSMUST00000102512 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Gm12362-201ENSMUST00000121986 342 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Gm14108-201ENSMUST00000122234 494 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Gm25804-201ENSMUST00000122785 188 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Gm11493-201ENSMUST00000134567 566 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Gm3617-201ENSMUST00000173076 555 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Gm20629-201ENSMUST00000176157 513 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Gm37486-201ENSMUST00000195663 405 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Fam162b-201ENSMUST00000020064 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Rce1-203ENSMUST00000224707 1255 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 AC122459.4-201ENSMUST00000228654 551 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Cd1d2-201ENSMUST00000041920 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Gm6684-201ENSMUST00000053717 685 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Olfr1511-202ENSMUST00000214168 1468 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Dcstamp-204ENSMUST00000227792 1367 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Gm6721-201ENSMUST00000218353 1445 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Rpl7a-ps13-201ENSMUST00000121692 563 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Gm15570-201ENSMUST00000122093 625 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Pcsk2os1-202ENSMUST00000156780 527 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Gm16350-201ENSMUST00000162958 446 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Sfta2-201ENSMUST00000171166 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Gm7583-201ENSMUST00000182941 1005 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 4933436E23Rik-201ENSMUST00000192824 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Gm43851-201ENSMUST00000200726 327 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Cyp2e1-203ENSMUST00000210235 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Arhgef9-204ENSMUST00000113882 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 AC110091.3-201ENSMUST00000213406 1304 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Gm43585-201ENSMUST00000199375 1403 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Gm14021-201ENSMUST00000117683 961 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Siglech-208ENSMUST00000173835 833 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Gm30301-201ENSMUST00000199474 652 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 AC163351.1-201ENSMUST00000225539 737 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 AC124555.1-201ENSMUST00000227051 880 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Sf3a3-201ENSMUST00000030734 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 AC139845.1-201ENSMUST00000147013 1334 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Tnfaip8-212ENSMUST00000179937 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Gm15033-201ENSMUST00000118188 673 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Gm8661-201ENSMUST00000118688 992 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Gm13472-201ENSMUST00000120948 314 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Banf2os-201ENSMUST00000124061 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 6330418K02Rik-202ENSMUST00000125662 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Gm11959-201ENSMUST00000148655 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Gm23899-201ENSMUST00000158112 90 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Gm22669-201ENSMUST00000158723 318 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 CT025603.2-201ENSMUST00000224369 484 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 3110009E18Rik-201ENSMUST00000027637 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Slc51b-201ENSMUST00000065894 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Gm6225-201ENSMUST00000181558 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Gm14705-201ENSMUST00000154109 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Ccl6-201ENSMUST00000019071 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 2900011O08Rik-201ENSMUST00000056521 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Rxfp2-202ENSMUST00000110496 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top2aQ01320 Gm7799-201ENSMUST00000133080 476 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms