Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Diexf-201ENSMUST00000085555 5570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Wdr37-212ENSMUST00000176922 3780 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Inpp5d-201ENSMUST00000042275 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 9130019O22Rik-201ENSMUST00000049052 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gcc2-201ENSMUST00000057659 6547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Ephb4-202ENSMUST00000111054 3784 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Irf4-202ENSMUST00000110307 4761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Abcc9-206ENSMUST00000205202 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Irf4-201ENSMUST00000021784 4764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Hinfp-205ENSMUST00000216508 5333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Cracr2a-203ENSMUST00000212051 7625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Nod2-201ENSMUST00000054324 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Bcl9-207ENSMUST00000166341 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Tfap2b-201ENSMUST00000027059 5863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms