Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Adar-203ENSMUST00000107405 5871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Qars-201ENSMUST00000006838 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Mmgt1-201ENSMUST00000059899 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Helz-201ENSMUST00000075012 6218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Irf9-203ENSMUST00000134863 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Zadh2-201ENSMUST00000060223 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Gm44741-201ENSMUST00000207503 2127 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Prrc1-201ENSMUST00000025490 4801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Oc90-201ENSMUST00000060522 1909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Gm21969-201ENSMUST00000178644 4402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Mthfr-202ENSMUST00000097788 2652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Rad51d-201ENSMUST00000018985 3426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Dhdh-201ENSMUST00000011526 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Wiz-203ENSMUST00000087703 4175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Fbxl20-201ENSMUST00000103143 8601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Ptprm-201ENSMUST00000037974 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 C130036L24Rik-202ENSMUST00000137643 3109 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Cyp4a12b-201ENSMUST00000094887 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Gm11988-201ENSMUST00000122321 1069 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Tgm7-201ENSMUST00000110675 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Btn1a1-201ENSMUST00000041674 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Prkcd-208ENSMUST00000112211 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Tmprss13-201ENSMUST00000034597 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Myrf-205ENSMUST00000189897 3339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Itgam-207ENSMUST00000098015 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Ptpn7-202ENSMUST00000167080 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Rph3a-204ENSMUST00000202406 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Scmh1-202ENSMUST00000064991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Ilf3-208ENSMUST00000214758 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Cyp2e1-201ENSMUST00000026552 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Tmem63c-203ENSMUST00000146292 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Slc2a4rg-ps-201ENSMUST00000127559 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Gm38001-201ENSMUST00000192900 3761 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 AC159813.1-201ENSMUST00000222671 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Pde11a-201ENSMUST00000099992 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Slc5a9-203ENSMUST00000102721 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Polr1bP70700 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms