Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 AC118006.2-201ENSMUST00000224167 962 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Dcun1d4-201ENSMUST00000063882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 4833412K13Rik-201ENSMUST00000195509 1479 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Enox2-202ENSMUST00000114911 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Gm5605-201ENSMUST00000208940 1305 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Colq-205ENSMUST00000150054 2867 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Fancb-202ENSMUST00000101082 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Btk-202ENSMUST00000113213 2121 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Cep57l1-209ENSMUST00000189770 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Ablim1-212ENSMUST00000111558 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Gm39307-201ENSMUST00000216780 1037 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Gm30709-202ENSMUST00000222476 956 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Gm26797-202ENSMUST00000213132 2562 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Thbs3-202ENSMUST00000119084 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf5P56477 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms